Satamaseurakunta tekee lähetystyötä osallistumalla rukouksin ja taloudellisesti Ateenassa toimivan Helping Hands -järjestön toimintaan. Helping Hands palvelee etupäässä Lähi-Idästä saapuvia pakolaisia. Sen päiväkeskukset tarjoavat tulijoille mahdollisuutta peseytymiseen, pyykinpesuun, ruokailuun, keskusteluun ja kielen oppimiseen. Kaikki tapahtuu kristillisen rakkauden hengessä. Toiminta tavoittaa viikoittain satoja pakolaisia.

Lähetystyötä koordinoi seurakunnassa Anni Sipilä.